占地面積比較大：在如何認定營業面積？辦公室、員工宿舍是否屬于經營面積？該部分面積是否應該獲得停產停業損失等方面？容易和拆遷人產生較大的分歧。
有大量機器設備：一些大型工廠企業，尤其是化工類企業，正常的生產經營需要大量的機器設備，這些機器設備一旦遇到拆遷不僅存在搬遷問題，也存在搬遷后機器設備的折舊、毀損，甚至是因為無法再找到合適的經營場所而面臨報廢的問題。
土地手續、經營證照存在瑕疵：很多工廠企業是八九十年代建造的，那時候取得土地、辦理經營手續沒有那么嚴格的要求，很多企業也因為歷史原因無法取得全部的批準許可文件，如果沒有拆遷，企業一直可以正常經營，但是一旦遇到拆遷，原來一些不起眼的小問題都會成為大問題，直接關乎補償高低的大問題。
人員需要安置：大型的企業遇到拆遷，除了貨幣補償和安置，還涉及到人員安置及保險的購買延續的問題。人員的安置關系到社會穩定是談判的很好的切入點。